Согласно википедии: "За последние время воздействие на экосистему Онежского озера интенсивно росло, особенно по фактору загрязнения. Наибольший пресс испытывают северо-западная и северная части озера, где расположены Петрозаводский, Кондопожский и Медвежьегорский промузел. Здесь сосредоточено 80 % населения и более 90 % промышленного потенциала бассейна. Учтённое загрязнение от трёх промузлов составляют порядка 190 млн м3 сточно-дренажных вод и 150 тыс. т выбросов в атмосферу за год. Объём техногенных стоков в бассейне Онежского озера составляет порядка 315 млн м3 в год, из них 46 % приходится на производственно-хозяйственные, 25 % — ливневой сток и 16 % — дренажно-мелиоративные воды. Поступление в озеро биогенных элементов составляет: фосфора — 810 т, общего азота — 17 тыс. т в год, а из озера с водами реки Свирь выносится 280 т фосфора и 11,8 тыс. т азота, то есть аккумулируется в озере 68 % фосфора и 31 % азота. Флот и моторные лодки (около 8000 единиц) с выхлопными газами, сбросом из систем охлаждения, утечками загрязняют водную среду преимущественно нефтепродуктами (порядка 830 т за навигацию), фенолами (0,5 т), свинцом (0,1 т), оксидами серы, азота и углерода."
Состояние Онежского озера и водоемов Карелии: